საიმედი სტერილიზაცია ხორციელდება სპეციალურ დალუქულ პაკეტებში მეხუთე თაობის ავტოკლავის გამოყენებით. კლინიკაში სტომატოლოგიური  ინსტრუმენტების დამუშავება ხორციელდება პროტოკოლის მიხედვით რაც გულისხმობს: